| 1回戦進出 |
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ペトルザルカ(スロヴァキア),
FKサルティド(ユーゴスラヴィア),
ハイデュク・スプリット(クロアチア),
モルデ(ノルウェー),
トルペド(ロシア),
マンチェスター・シティー(イングランド),
OBオーゼンセ(デンマーク),
グロクリン(ポーランド),
ゼリエズニカル(ボスニア),
セメンタルニカ(マケドニア),
カメン(クロアチア),
カルンテン(オーストリア),
コケレン(ベルギー),
サマス(スイス),
エスビャウ(デンマーク),
SKMプコフ(スロヴァキア),
ノルドシアエランド(デンマーク),
オリンピヤ(スロヴェニア),
ジンブル・チシナウ(モルドヴァ),
ステアウア(ルーマニア),
ジズコフ(チェコ共和国),
ダンディー(スコットランド),
ブロンドビー(デンマーク),
デブレツェン(ハンガリー),
APOELニコシア(キプロス),
ランス(フランス),
ドニプロ(ウクライナ),
レッドスター(ユーゴスラヴィア),
ハポエル・テルアヴィヴ(イスラエル),
AIK(スウェーデン),
フェレンクヴァロス(ハンガリー),
パブリクム(スロヴェニア),
マルメーFF(スウェーデン),
マッカビ・ハイファ(イスラエル),
ミパ(フィンランド),
ディナモ・ブカレスト(ルーマニア),
リン(ノルウェー),
レイリア(ポルトガル),
レフスキ・ソフィア(ブルガリア),
ヴァルテクス(クロアチア),
FKヴェンツピルス(ラトヴィア)
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| 1st-leg 2003.8.12 |
| FKサラエヴォ(ボスニア) | 1 | - | 1 | FKサルティド(ユーゴスラヴィア) | |
| ハカ(フィンランド) | 2 | - | 1 | ハイデュク・スプリット(クロアチア) | |
| ヴァレッタ(マルタ) | 0 | - | 2 | サマス(スイス) | |
| 1st-leg 2003.8.13 |
| FKヴェンツピルス(ラトヴィア) | 1 | - | 1 | ヴィスラ・ポロック(ポーランド) | |
| 1st-leg 2003.8.14 |
| AIK(スウェーデン) | 1 | - | 0 | フィルキル(アイスランド) | |
| APOELニコシア(キプロス) | 2 | - | 1 | デリー(アイルランド) | |
| OBオーゼンセ(デンマーク) | 1 | - | 1 | TVMKタリン(エストニア) | |
| PFCリテス・ロヴェチ(ブルガリア) | 0 | - | 0 | ジンブル・チシナウ(モルドヴァ) | |
| SKMプコフ(スロヴァキア) | 3 | - | 0 | シオニ(グルジア) | |
| アティラウ(カザフスタン) | 1 | - | 4 | レフスキ・ソフィア(ブルガリア) | |
| エクラナス(リトアニア) | 1 | - | 1 | デブレツェン(ハンガリー) | |
| エスビャウ(デンマーク) | 5 | - | 0 | サンタコロマ(アンドラ) | |
| エトゼラ(ルクセンブルク) | 1 | - | 2 | カメン(クロアチア) | |
| オリンピヤ(スロヴェニア) | 1 | - | 0 | シルブルン(アイルランド) | |
| カルンテン(オーストリア) | 2 | - | 1 | グリンダヴィク(アイスランド) | |
| クンブラン(ウェールズ) | 0 | - | 3 | マッカビ・ハイファ(イスラエル) | |
| グロクリン(ポーランド) | 2 | - | 0 | アトランタス(リトアニア) | |
| コールレイン(北アイルランド) | 2 | - | 1 | レイリア(ポルトガル) | |
| ジズコフ(チェコ共和国) | 3 | - | 0 | ゼニス・アスタナ(カザフスタン) | |
| セメンタルニカ(マケドニア) | 0 | - | 0 | カトーウィツェ(ポーランド) | |
| ゼリエズニカル(ボスニア) | 1 | - | 0 | アノルトシス(キプロス) | |
| ディナモ・ティラナ(アルバニア) | 0 | - | 4 | コケレン(ベルギー) | |
| ディナモ・ブカレスト(ルーマニア) | 5 | - | 2 | リエパヤ・メタルグス(ラトヴィア) | |
| トルペド(ロシア) | 5 | - | 0 | SPドマグナーノ(サンマリノ) | |
| ネメン(ベラルーシ) | 1 | - | 1 | ステアウア(ルーマニア) | |
| ハポエル・テルアヴィヴ(イスラエル) | 1 | - | 1 | バナンツ(アルメニア) | |
| パブリクム(スロヴェニア) | 7 | - | 2 | ベラシカGC(マケドニア) | |
| ビルキルカラ(マルタ) | 0 | - | 5 | フェレンクヴァロス(ハンガリー) | |
| ノルドシアエランド(デンマーク) | 4 | - | 0 | シラク(アルメニア) | |
| ブロンドビー(デンマーク) | 3 | - | 0 | ディナモ・ミンスク(ベラルーシ) | |
| ペトルザルカ(スロヴァキア) | 1 | - | 0 | F91ドュードラング(ルクセンブルク) | |
| マルメーFF(スウェーデン) | 4 | - | 0 | ポルタダウン(北アイルランド) | |
| マンチェスター・シティー(イングランド) | 5 | - | 0 | TNSランサントフレイド(ウェールズ) | |
| ミパ(フィンランド) | 3 | - | 2 | ヤングボーイズ(スイス) | |
| モルデ(ノルウェー) | 2 | - | 0 | KIクラクスヴィク(フェロー諸島) | |
| ランス(フランス) | 3 | - | 0 | トルペド・クタイシ(グルジア) | |
| ラヴァディア・マールドゥ(エストニア) | 1 | - | 3 | ヴァルテクス(クロアチア) | |
| ルナヴィク(フェロー諸島) | 1 | - | 3 | リン(ノルウェー) | |
| レッドスター(ユーゴスラヴィア) | 5 | - | 0 | ニストル・オタシ(モルドヴァ) | |
| ヴァドュス(リヒテンスタイン) | 0 | - | 1 | ドニプロ(ウクライナ) | |
| ヴラズニア(アルバニア) | 0 | - | 2 | ダンディー(スコットランド) | |
| 2nd-leg 2003.8.28 |
| F91ドュードラング(ルクセンブルク) | 0 | - | 1 | ペトルザルカ(スロヴァキア) | |
| FKサルティド(ユーゴスラヴィア) | 3 | - | 0 | FKサラエヴォ(ボスニア) | |
| ハイデュク・スプリット(クロアチア) | 1 | - | 0 | ハカ(フィンランド) | |
| KIクラクスヴィク(フェロー諸島) | 0 | - | 4 | モルデ(ノルウェー) | |
| SPドマグナーノ(サンマリノ) | 0 | - | 4 | トルペド(ロシア) | |
| TNSランサントフレイド(ウェールズ) | 0 | - | 2 | マンチェスター・シティー(イングランド) | |
| TVMKタリン(エストニア) | 0 | - | 3 | OBオーゼンセ(デンマーク) | |
| アトランタス(リトアニア) | 1 | - | 4 | グロクリン(ポーランド) | |
| アノルトシス(キプロス) | 1 | - | 3 | ゼリエズニカル(ボスニア) | |
| カトーウィツェ(ポーランド) | 1 | - | 1 | セメンタルニカ(マケドニア) | |
| カメン(クロアチア) | 7 | - | 0 | エトゼラ(ルクセンブルク) | |
| グリンダヴィク(アイスランド) | 1 | - | 1 | カルンテン(オーストリア) | |
| コケレン(ベルギー) | 3 | - | 1 | ディナモ・ティラナ(アルバニア) | |
| サマス(スイス) | 2 | - | 0 | ヴァレッタ(マルタ) | |
| サンタコロマ(アンドラ) | 1 | - | 4 | エスビャウ(デンマーク) | |
| シオニ(グルジア) | 0 | - | 3 | SKMプコフ(スロヴァキア) | |
| シラク(アルメニア) | 0 | - | 2 | ノルドシアエランド(デンマーク) | |
| シルブルン(アイルランド) | 2 | - | 3 | オリンピヤ(スロヴェニア) | |
| ジンブル・チシナウ(モルドヴァ) | 2 | - | 0 | PFCリテス・ロヴェチ(ブルガリア) | |
| ステアウア(ルーマニア) | 0 | - | 0 | ネメン(ベラルーシ) | |
| ゼニス・アスタナ(カザフスタン) | 1 | - | 3 | ジズコフ(チェコ共和国) | |
| ダンディー(スコットランド) | 4 | - | 0 | ヴラズニア(アルバニア) | |
| ディナモ・ミンスク(ベラルーシ) | 0 | - | 2 | ブロンドビー(デンマーク) | |
| デブレツェン(ハンガリー) | 2 | - | 1 | エクラナス(リトアニア) | |
| デリー(アイルランド) | 0 | - | 3 | APOELニコシア(キプロス) | |
| トルペド・クタイシ(グルジア) | 0 | - | 2 | ランス(フランス) | |
| ドニプロ(ウクライナ) | 1 | - | 0 | ヴァドュス(リヒテンスタイン) | |
| ニストル・オタシ(モルドヴァ) | 2 | - | 3 | レッドスター(ユーゴスラヴィア) | |
| バナンツ(アルメニア) | 1 | - | 2 | ハポエル・テルアヴィヴ(イスラエル) | |
| フィルキル(アイスランド) | 0 | - | 0 | AIK(スウェーデン) | |
| フェレンクヴァロス(ハンガリー) | 1 | - | 0 | ビルキルカラ(マルタ) | |
| ベラシカGC(マケドニア) | 0 | - | 5 | パブリクム(スロヴェニア) | |
| ポルタダウン(北アイルランド) | 0 | - | 2 | マルメーFF(スウェーデン) | |
| マッカビ・ハイファ(イスラエル) | 3 | - | 0 | クンブラン(ウェールズ) | |
| ヤングボーイズ(スイス) | 2 | - | 2 | ミパ(フィンランド) | |
| リエパヤ・メタルグス(ラトヴィア) | 1 | - | 1 | ディナモ・ブカレスト(ルーマニア) | |
| リン(ノルウェー) | 6 | - | 0 | ルナヴィク(フェロー諸島) | |
| レイリア(ポルトガル) | 5 | - | 0 | コールレイン(北アイルランド) | |
| レフスキ・ソフィア(ブルガリア) | 2 | - | 0 | アティラウ(カザフスタン) | |
| ヴァルテクス(クロアチア) | 3 | - | 2 | ラヴァディア・マールドゥ(エストニア) | |
| ヴィスラ・ポロック(ポーランド) | 2 | - | 2 | FKヴェンツピルス(ラトヴィア) | |
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